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马库斯被调到南极基地后，谢尔盖弗拉基米尔博士研制的超级智能电脑-33红后，也被安置到了南极研究中心，这个期间谢尔盖弗拉基米尔博士为了测试红后的子系统和主系统各项功能，在浣熊市地下实验基地“蜂巢”布置了红后的子系统，用来负责检测“蜂巢”，管理地下基地各项设施。
转眼间有时三年过去了，在这期间保护伞公司继续发展壮大着，3年里松平命令公司特殊作战部队，到处抓捕流浪人员提供给马库斯做人体实验，在一次实验里马库斯意外得到了，不完美药剂，这种病毒共有七支，使用后无法获得超自然能力，不过却可以极大的提升人的体质，甚至可以让一些先天瘫痪的人能够正常生活，并且可以大幅度提高人类的寿命，缺点就是要不定时的给自己持续注射药剂。
不完美药剂的报告送到松平的桌子上，松平看到后，非常满意，在公司的董事会上大力的表扬了马库斯，得到不完美药剂的松平，把它交给了蓝色部门，在蓝色部门经过一年多的实验后，终于可以实现小批量的生产。
在可以小批量生产不完美药剂后，松平私下对马库斯下令，以后研究完美药剂的报告全部直接送到松平这里，为了确保南极研究中心的安全，松平严格控制了信息渠道，公司前往非洲研究中心的研究人员身份被严格保密，并且雇员对外通信也受到了严格的限制，并把伍德调往南极研究中心。
在研制出不完美病毒后，马库斯越发的对目前的人体实验不满意起来，这些被松平命令抓来的的实验体多是一些流浪汉，这些人由于没有受过高等教育，并没与能力清楚的描述出自己在感染病毒后变异的感受，丧心病狂的马库斯，开始在自己的身上做人体实验，然而一次意外，马库斯实验室里的水蛭女王进入了他的身体里，马库斯由此陷入沉睡。
这件事被基地里的主控电脑红后发现，接到通知的松平，本打算派人去接手南极研究基地，后来想想这样也好。反正自己和美和子不需要这些始于太阳阶梯的病毒药剂，没有了马库斯，完美药剂研制成功就遥遥无期，对于松平来说不完美药剂才是完美的，这样所有使用了不完美药剂的使用者，牢牢的绑在保护伞公司的战车下，最后松平撤回了保护伞在南极的特殊作战部队，命令红后关闭了南极研究基地，松平不知道的是，在所有人员撤离南极基地后，本因陷入休眠的红后，在无人控制的情况下再次启动了。
经过这件事后，斯宾塞也开始了自己的生化研究，和马库斯不一样，斯宾塞的像松平提交了一份“W计划”。该计划就是从世界各地寻找有着优秀的儿童，并将其集中培养。这些孩子全部被改姓氏为威斯克，给予了他们教导和灌输后，在安布雷拉的全方位监视下，他们被安置在世界的各个角落的安排好的环境中，待时机成熟，将始祖病毒的变异体注射到他们身上，存活者将成为公司的超级打手。该计划最终只有阿尔伯特·威斯克一人获得了超人能力，斯宾塞在威斯克获得超能力后，借助威斯克的超能力慢慢的压制了松平留在自己脑海的一段特殊的精神力。
在欧洲的保护伞公司总部底下大本营，谢尔盖弗拉基米尔博士多年前在松平的命令下，开始研制的生化兵器，记过几年的研发，在总部的超级智能电脑白后的恐怖计算力协助下，终于取得了突破性的进展。
目前公司的生化兵器主要有2大类型，
舔食者-眼睛退化没有视觉，其捕杀完全靠敏锐的听觉，走路、奔跑、甚至连呼吸和心跳声都难逃过它的耳朵。不会直立行走，但却可以依靠强有力的四肢和爪子在墙壁甚至房顶上倒挂攀爬，加上超有力的弹跳和飞快的行动速度使得连发扫射的武器都很难击中它们。配合安装在大脑内的生物芯片，可以敌我识别并且服从简单的命令。在城市巷战以及小规模的遭遇战堪称步兵杀手，目前保护伞公司已经可以大规模的量产这种恐怖生物兵器。
暴君-拥有残忍，能摧毁一切的力量，无限的体能以及其高人一等的智力。都拥有自己专属的武器，为的就是不折手段达成目标。追迹者通过实验，它们本身是拥有自己独立的思维能力，配合大脑内的微型生物电脑，追迹者能用他自己的武器击毁直升机以及还能清楚认定以及记住它的目标。能快速恢复意志力生化武器，最算带着重型武器其奔跑速度还是一样快，以及被重型武器重伤后也只是暂时性丧失能力。配合步兵在攻坚战中无往不利。在公司幕后老板松平的干预下，暴君的形态经过了修饰，正常形态的暴君，一个3米高的光头恶汉，身上穿有一套连身带有大量精钢配件的黑色大风衣，手戴特制合金手套、脚穿精钢战靴。手提特制机载加特林机炮。肩扛毒刺防空导弹。近战可化身追击者，手变巨大利爪，拥有恐怖的近战能力，可以轻易的掀翻主战坦克。目前可以实现小规模量产。
在智能电脑研制成功后，比起生物兵器，传统的钢铁战车飞机发展的更加恐怖。
自走战车-无需驾驶人员的战车，行军状态战车配有2挺车载加特林，禁止状态放下辅助支架，可从巨大的机腹伸出加农炮，进行超远程打击。通过主控电脑，自走战车可以准确的识别敌我双方，可以听懂已方士兵的语音命令，经过主控电脑分析命令准确性后，允许执行，可以协助士兵作战，如果士兵命令被判断为错误命令，会自动驳回命令。
无人战机-可以垂直起降的螺旋战机，升降状态为直升机形态，2个螺旋桨在飞机上方，起飞后，螺旋桨会自动切到前方，机腹2侧配有2个喷气式发动机，可以极大的提高战机速度。同样拥有智能化的主控电脑。
拿到报告的松平决定大规模增目前的各大研究中心的武装力量，各个研究中心在建立的时在松平的命令下，每个研究中心下方秘密的预留了一个占地巨大的底层仓库，在各个研究中心的墙壁里都埋有各种检测装置，除了固有激光通道，研究中心的地面.墙壁.天花板.都埋藏了大量的武器有激光发射装置，炸药陷阱，墙壁机枪等等，这些装置只有各个研究中心的负责人一人知道，要想启动这些秘密装置只有通过研究中心的主控智能电脑的权限验证才可以，想要通过智能电脑想要验证必须要有松平的授权。
底层仓库，在松平命令的下开始秘密运来大批冷冻装置，和集装箱，直到占满整个仓库，在仓库的中心放置了一个巨大的炸弹，在基地遭遇大规模入侵，智能电脑可经过松平的直接授权，使用各种隐藏武器。防守失败，敌人大量入侵，可进入战时法令，解封冰冻在底层仓库里的舔食者。和特别量产的矮个子暴君。在基地所有防御被攻破后，智能电脑就会直接启动自曝系统，炸毁整个基地。