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林杨一下子传到了莫菲斯指挥的飞船当中，可得一队船员，包括莫菲斯本人都下了一跳。他们已经将尼奥的，真身，从废弃水池中捞了上来，正在治愈。林杨看到了尼奥赤裸着躺在床上，身上插满了各种管子。
与在现代城市不同，反抗队员的穿着十分简陋和朴素，以此可以用来分辨所谓的，虚拟，和，现实，！林杨依旧是酷酷的黑色风衣，戴着墨镜。
，你是怎么来到这里的？，莫菲斯诧异的问道，在他心中，虚拟世界的人其实都是计算机的代码，而这里现实世界。
从科学物理的角度来讲，代码如果不存在犹如尼奥一般的肉身，怎么可能来的这里？而且还来得如此夸张。虽然先知预见到林杨是侵入者，很厉害。但是，莫菲斯一直认为，再厉害也是在虚拟世界中的。在现实中，人类只是血肉之躯，是没有办法和计算机生产的电子乌贼直接对抗的。
存在这个疑问的，不止是莫菲斯，每一个船员都是如此。他们用不可理解的眼光看着一身黑衣的林杨。
林杨没有直接回答莫菲斯的问话，当他可以用手表传送到这里的时候，他就清楚了，这一切都是虚拟的，不同的是，矩阵高明的将它们分开，矩阵越来越了解人的感情和思维，它清楚人是有信仰和精神的，它必须作出一个世界，让那些反抗者有一个精神的家园，有一个基地，这样的话，就可以让主体的虚拟社会，也可以说主程序更加的稳定。当反叛者实力增大的时候，再将其删除，所以说，锡安基地历史上已经被摧毁五次了。但此时，林杨不想告诉莫菲斯他们，也可能自己说了，他们也不会相信，他现在要做的就是，如何依靠锡安基地，打败矩阵，或者可以说，让其妥协，那个时候，可能就可以找到神器精华了。
林杨走到未醒的尼奥身旁，看了看他。他的皮肤苍白，身体虚弱，由于长期在胚胎中，他的肌肉快要萎靡了。
，他的情况怎么样？，林杨问道莫菲斯。
，还好了。，莫菲斯走过去瞧了瞧这些仪器针管，接着说道：，现在还比较虚弱，不过，已经不会有生命危险了。哦，救世主终于被我们带回来了。，
林杨点了点头，微微的笑了一下，然后说道：，离〖自〗由又进了一步，对吗？，
莫菲斯点点头，接着说道：，现在他没有事了，等他醒来，我就会和他说明这一切真相，现在和我们说说你吧，坦率地说，你比尼奥要神秘多了，让我们了解一下你，还有，我还是不明白，你到底是怎么一下子就来到这里的……虽然你吃了红色药丸，但是……你知道，我们并没有打捞你鼒…，
林杨看着莫菲斯，又扫了一眼司样疑惑的其他人，心中暗想，不能告诉他们真相，但是又不能毫无解释，这确实是一件十分为难的事。他低头想了想，开始了尽量符合逻辑的胡诌。
，你知道的，我是个侵入者，你给我的红色药丸其实是个跟踪器对吧？，林杨说道。
，是的。，莫菲斯肯定了这一点。
，其实，我并不是生活在这个母体中的人，在矩阵中你们也可以把我理解成一个突然进入的病毒，我有自主意识，我的真身也没有想你们的那样成为电池，所以，当我接收到你们的跟踪系统之后，就从矩阵中出来，并且真身也获得了〖自〗由，详细枪……可能你们无法理解，但那不重要，现在重要的是，我可以和你们一起行动，反抗矩阵……林杨一边说，一边走动着欣赏起这架飞船。
他的话自然是让一众人无法明白，因为这确实超出了他们的想象，要不是先知曾经预言过侵入者，他们有可能会崩溃。
，你为什么会和我们一起，嗯……我的意思是……先知并没有说你的目的…………莫菲斯继续问道。
，你们为什么反抗矩阵？，林杨背过手反问道。
，我们为了人类的生存和〖自〗由。，莫菲斯很笃定地说道。
，好吧，我也是。，林杨缓缓地说道，此刻林杨越发的感到，他没有勇气向莫菲斯乃至整个锡安的人说出真相。
撕碎一个人的梦想是很残忍的青！
莫菲斯皱着眉点了点头，他依旧是不理解林杨的来历，但是眼前的事实是，这个所谓的侵入者活生生的站在他的飞船中，而且还和他们一条战线，于是他也没有再多想了。
，OK 我们欢迎你的加入。，莫菲斯终于伸出了手。
，谢谢你的信任。，林杨握着他鼋大的手掌说道。
，来，我给你介绍一下我的队员。，莫菲斯笑着说道”这位是崔尼蒂……，说着他的手摆向了这位干练的女孩”你对她应该不陌生。，林杨微笑着和崔尼蒂握手，然后说道：，当然，我们在矩阵中交过手。，
崔尼蒂同样对林杨报以微笑，接着说道：，我很惊讶你强大的本领。，
，哦，崔尼蒂，那只是在虚拟的矩阵中。，这时旁边一位黑皮肤的小伙子说道，他看上去有些象墨西哥人”但是，我依然佩服，我叫坦克，是飞船的接线员。，
看过电影的都知道这个热情而又专业的坦克。
，幸会”林杨笑着和他握手，接着说道：，有一天，也许你会发现我在现实中也很强大。，
，呵呵，我喜欢你的幽默。，惧支笑道。
林杨耸了耸肩，没有反驳他。，哦，这位是赛弗，战斗队员……，莫菲斯继续介绍道。
，你好，林！我们早就知道了你……一个光头留着山羊胡子的人同样微笑着和林杨握手。
这个人，其实不用介绍，林杨也会记在心里。这个家伙在黑客帝国中是个叛徒，他其实早就私下里和杀毒特工史密斯联系上了。他厌倦了人类反抗组织清贫困苦的生活，他很后悔当时为什么不选择蓝色的药丸。从而活在所谓的梦中，正是由于他的出卖，这架飞船中的大部分队员都牺牲了，莫菲斯还被史密斯抓住了。
林杨眯起眼肺，看了看这个人，他很讨厌叛徒。无论是那一方的，但是此刻林杨并没有直接揭穿和杀了他。一来自己刚到，揭穿他，没有人会相信，他为了达到最后的目的，此刻不便轻举妄动。第二，自己目前的实力，完全可以控制住局面，所以，先稳一下，观察两天也好。看看这个家伙怎么和史密斯联系，说不定可以有将计就计的办法。，你好”林杨冷冰冰的和赛弗我了一下手。就把脸转向其他人了。
“这是艾巴、苏薇琪他是坦克哥哥道瑟这个是莫森”莫菲斯将队员们一个个的介绍给了林扬。
这些人和电影中都是一样的。
“认识你们很高兴。”林扬手一摆说道：“我们以后并肩作战了，希望一起改变这个世界。”
“开饭了。”莫森说道。他是这些队员中最年轻的。
“尝一尝我们这里的晚餐怎么样？”莫菲斯笑道。林扬点了点头，然后又看了看昏迷中的尼奥。
“不用担心他，他再有两天就能醒过来。”莫菲斯走过去拍了拍林扬的肩膀，然后走进了飞船的餐厅。
这架飞船虽说电子设备挺先进，但是没有什么装饰，整个飞船内部看起来很灰暗，如同队员身上的工作服一样。餐厅更是简陋，一张铁质的长桌，两排长椅，莫森从一架类似于冰欺凌机中，挤出了一团粘稠的白色食物，放到了林扬的面前。
队员们都做到了长椅上，拿起勺子一口一口的将这些粘稠物吃下。林扬将鼻子放到食物上闻了闻，没有任何味道。
“呵呵，我们这里条件简陋，比不得在矩阵之中，但是这都是〖真〗实的人类食物，虽然味道没有，不过它包含着人体所需要的维他命，水分，葡萄糖”莫菲斯看着林扬缓缓的说道。
“莫菲斯”林扬笑着拿起勺子舀了一口，放进嘴中，咽了下去，然后说道：“在你心目中，认为什么是〖真〗实的，什么是虚拟的。”
“呵呵。”莫菲斯用一块餐布抹了抹嘴，笑着说道：“觉醒了，就是〖真〗实的虽然很残酷，但是这是事实。”有些时候，人们宁可相信完美的谎言，也不愿意相信有缺憾的〖真〗实———“你认为这很可悲吗？”林扬问道。
莫菲斯叹了口气，接着看了看他的几位队员，然后说道：“说不好，现在我只知道，觉醒的人越多，我们战胜矩阵的希望也就越大，人类就越接近〖自〗由。”
林扬也不知道说什么好，他扬了扬眉毛，默默的低下头，吃了一口根本“不存在”的食物。
“等尼奥醒了，我想带着你和他，一起去见先知。”莫菲斯接着说道。
林扬点了点头，然后说道：“好的，我正想见一见她呢。”
坦克这个时候，忽然看了看林扬的后脑处，好像发现新大陆一样的喊了一句：“哦，我的上帝你你是个自然出生的人类？”
听到这句话，大家都看向了林扬。在这个位面，凡是矩阵培育出来的人，后脑都会有一个插孔，那是链接矩阵用的。
林扬瞥了一眼大伙，笑着对坦克说道：“用不着这么大惊小怪的，你不也一样吗？”
“我是自然人，当然没有插孔了。”坦克笑道。他看上去挺自豪这一点的。
莫菲斯想了想，诧异的瞪着眼睛问了一句“如果没有插孔，你是如何进入到矩阵的？”