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无论是在清廷入关前，还是入关后，由多尔衮亲手杀死的，和他下令杀死的汉族人都不在少数。但多尔衮却十分明白,把汉人全部杀光这种论调，根本就不可能，这到不是说多尔衮心慈手软，或者是打算建设一个真的满汉一家的国家。
因为多尔衮十分清楚，仅仅只靠满族人，别说是整个中国，就是关外的那一块土地，都统治不了，到现在这个时候，满族的人口一共才二百多万，一个北京地就足够装下满族人口的一半了,就算是把汉八旗的人口加进来,也不超过三百万,就这么一点人口,连一个省都不够,还谈什么统治整个中国。
因此汉人不是不能杀，但不能一味乱杀，在入关之前，屠城杀人，是为了宣扬清军的军威，在明军中植入对清军的恐惧感，也可以消弱明朝的力量；而在入关以后，杀人则是为了立威，以恐怖手段来控制汉人，打消他们的抵抗意志，全面服从清廷的统治。杀人都是有原因，有目地的，并不是心血来潮，纯为了杀人而杀人。
而且假如说是真的要把汉人全都杀，只会把所有的汉人全都都推到清廷的对立面去，汉人的人数，何止是满族后百倍，虽然在多尔衮眼里，汉人都是软弱、胆小、无能之辈，但如果是在左右都是死的情况下，多尔衮也相信，汉人一定会起来拼死反抗的。
当然如果是在以前，多尔衮或许也不会太在意，有多少人反抗，就杀多少人，最多也就是麻烦一点。但现在有南京朝廷存在，己经成为不少北方汉人的希望所在，多尔衮显然不能把所有的汉人全部都推到南京朝廷的那一边去。那样的话，清廷就是自取灭亡了。
因此在南征失利之后，多尔衮在施政上，在不影响原则的前提下，明显对汉人怀柔了许多，不仅打出了满汉一家的旗帜，而且对一部份向清廷效忠的汉族官员也多加笼络，甚致在条件并没有完全成熟的情况下，举行清廷的开科取士，以收垄北方汉人的人心，并在平时也极力劝告满州贵族，对汉人的态度要好一些，目地就是为了缓和满汉之间的对立情绪，以加强汉人对清廷的归属感。
这近两年的时间里，多尔衮这些工作也确实取得了一些成效，满汉对立情绪缓和了不少，一些汉官的积极性也明显加强了许多，清廷的经济情况能够明显好转，朝廷的财政收入能够得到提高，汉官在里面所发挥的作用至少占了五成以上，而另外五成中，有三成都是关外汉官的作用，实际上八成的工作，都是由汉族的官员来完成的。
当然多尔衮的这些做法，也得到了一部份思想开明的满族贵族的支持，但他也知道，在满人当中，有一少部份极端的满族主义者对这些做法十分不满，但有自己在上面压制着，就算是心有不满,也不敢表露出来。同时也有一批满族贵族喜欢故意找一些汉族官员的碴口，对他们进行辱骂，甚致是抠打，以显示对汉官的蔑视与不屑，但他们所针对的，只是中下层汉官，对高级汉官，还没有人敢当众驱打。
因此也可以说，虽然在小节上还有些不尽如人意，但在这两年的时间里，民族矛盾也确实缓和了许多。只是多尔衮没有想到的是，这些都只是表面现像，只要清廷一天没有真正的统一中国，满汉之间的矛盾就一天不能真的消除，仅仅只是被掩盖了起来而己。
而这一次的动乱，就是一次满汉之间的矛盾大爆发，而代善的意外死亡，使满汉之间的矛盾并未随动乱被平息之后而缓和，相反还进一步激化，一直沿续到了现在，大有愈演愈烈之势。
多尔衮忽略了满汉矛盾的激化，也不是没有原因，因为这段时间以来，他的主要精力都放在调查代善的死亡原因上。代善并不是真的被暴民打死，而是被手榴弹炸死，这种手榴弹多尔衮见过，是从中华军那里缴获过来的。
而且根据调查，在这一次动乱中，一共在十一个地点发了手榴弹爆炸的情况，每一次都是发生在暴民与清兵对持的关建时刻，帮助暴民在僵持不下，或是陷入下风时调转了局面。可以说如果没有这十一次手榴弹爆炸，暴民引发的动乱就会小得多。
因此多尔衮也基本可以断定，这次动乱的背后，绝对是南京派到北京潜伏的谍报人员在推动操纵。这是商毅向清廷施实的报复手段。
北京有南京的谍报人员潜伏，多尔衮并不觉得意外，正如南京也有清廷的谍报人员一样。但和清廷的谍报人员在南方屡屡做出一些举动来不同，南京的谍报人员在北京表示得十分低调，主要的工作是收集情报，了解清廷发生的重大事情，并未做什么其他的事情。
在六七月份的时候，清廷的谍报人员对南京发动了一次行动，釆用分化、利诱的办法，使周、林两家的几名重要人员违反法令，而受到了处罚。尽管这一次行动是甴魔门独立策化完成的，但多尔衮得知以后，还是十分高兴，认为这确实是对付南京的一个重要手段，因为南京政府一直都是以公证、开明、廉洁的形像出现，因此很得人心，而清廷的方法是破坏这种形像，拉垄、引诱南京政府的官府腐化、坠落。
一但商毅严格处理这些官员，受处理的官员必然对商毅怀恨在心，清廷可以再趁机拉垄、收买，使其为已所用，并且分化南京政府的内部；而如果商毅选择网开一面，那么清廷则可以借题发挥，败坏南京政府的名声和形像。在无形中将商毅逼入了一个两难的境界中。因此虽然这一次的结果是以商毅秉公处理而结束，但淸廷还是达到了部份目地。林家己经被迫分了家。
而同样的手段，商毅却无法反用于清廷，因为清廷根本不会再乎自己的这些名声，南京政府处理的这四件事情，在清廷来说，根本就不算事。因此虽然在随后，清廷的谍报系统遭到了南京政府的沉重打击，但多尔衮仍然认为，以后还可以这么办，只是办得再隐密一点。
只不过多尔衮没有想到的是，商毅的报复行为会来得这么快，而且是从自已预想不到的地方下手，还一出手就找到了清廷的命门，就是满汉关糸。
现在从整体来看待这次丁亥之变时，多尔衮就发现，南京的方法其实也不复杂，就是挑起并激化满汉关糸，然后找一个机会制造动乱，引发汉人的大暴乱。也不得不说，商毅的这一出手，也确实很准。
虽然现在多尔衮想通了这一点，但也十分杯催的发现，自巳对商毅的这一招也同样无解。如果自己在处理善后的时候偏袒满人，无疑就将汉人都推进了南京政府的那一边，对清廷来说，这无疑是一个灾难性的结果；而如果护着汉人，则这边的满人也不会答应，不管怎么说，清廷的基础还是建立在满人的部落统治上。这才是让多尔衮觉得左右为难的地方。
而且这一招清廷也同样不能反用于南京，因为南京政府的统治，是建立在稳定的民众支持基础上，商毅、政府和中华军在民众之中也有非常高的威信力，而且现在也并没有尖锐的对立矛盾，因此也可以说，想在南京政府的统治区內，煽动百姓起来聚众闹事作乱，根本就是不可能的事情。
另一方面，虽然多尔衮心里明知，这次暴乱的背后，有南京政府的谍报人员在指挥、组织，并且也派人进行严密的监查，但一连过去了五六天的时间，据然一点线索都没有发现，这也让多尔衮觉得郁闷不己。为什么清廷的间谍在南京搞了一点事情，就立刻被南京方面全都揪出来了呢？
其实这也是有两方面的原因，一是发生大动乱，本身就可以浑水摸鱼，掩盖住许多线索。另一方面，这一场动乱，是经过了南京方面精心的策划、安排、组织，商毅甚致为此还推迟了出发去马尼拉的时间，整个过程、每一个环节都进行了反复的研究，以确保万无一失；同时所有亲身参与这一场动乱的人员都在事先和情报网络分离，并有各种其他身份掩护，而在完成任务之后，参与的人员也将立刻全部撤回南方，不会给清廷留下任何线索；而且南京建立的谍报糸统，也远比清廷的严密，绝大部份人员都是单线联系，因此就算被清廷抓住一两个人，也不会对整个北京的情报网络造成太大的损失。
时间一天天过去，转眼就到了顺治五年(1648年)的腊月三十，新年来临，而满汉对立的情绪不仅没有缓解，还有愈演愈烈的发展驱势，多尔衮也意识到，事情再也不能拖下去了，必须拿出一个解决的办法来。